Przetargi.pl
Sukcesywne usługi analizy transkryptomowej RNA wyizolowanego z korzeni dębu szypułkowego dla Instytutu Dendrologii PAN w Kórniku do 31 grudnia 2020 roku.

Instytut Dendrologii PAN ogłasza przetarg

  • Adres: 62-035 Kórnik, ul. Parkowa
  • Województwo: wielkopolskie
  • Telefon/fax: tel. 618 170 033, , fax. 618 170 166
  • Data zamieszczenia: 2020-03-23
  • Zamieszczanie ogłoszenia: obowiązkowe

Sekcja I - Zamawiający

  • I.1. Nazwa i adres: Instytut Dendrologii PAN
    ul. Parkowa 5
    62-035 Kórnik, woj. wielkopolskie
    tel. 618 170 033, , fax. 618 170 166
    REGON: 32615000000000
  • Adres strony internetowej zamawiającego: http://www.idpan.poznan.pl/bip
  • I.2. Rodzaj zamawiającego: Nauka (Instytut Naukowy Polskiej Akademii Nauk)

Sekcja II - Przedmiot zamówienia, przetargu

  • II.1. Określenie przedmiotu zamówienia
  • II.1.1. Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
    Sukcesywne usługi analizy transkryptomowej RNA wyizolowanego z korzeni dębu szypułkowego dla Instytutu Dendrologii PAN w Kórniku do 31 grudnia 2020 roku.
  • II.1.2. Rodzaj zamówienia:
  • II.1.3. Określenie przedmiotu oraz wielkości lub zakresu zamówienia:
    Sukcesywne usługi analizy transkryptomowej RNA wyizolowanego z korzeni dębu szypułkowego. Zadanie 1. Analiza maksymalnie 75 próbek Zadanie 2. Analiza maksymalnie 90 próbek. Próbki dostarczane będą sukcesywnie partiami w trakcie trwania umowy. Zamawiający planuje wysłanie próbek w 2 do 4 transzach . W zakres świadczonej usługi dla Zadań 1-2 muszą wchodzić: • Przygotowanie bibliotek z wykorzystaniem dostarczonego, wyizolowanego z prób całkowitego RNA, na potrzeby sekwencjonowania NGS przy pomocy sekwenatora firmy Illumina przy użyciu oryginalnych zestawów Illumina zachowujących informację o kierunku transkryptu. • Sekwencjonowanie RNA-seq (sekwenator Illumina HiSeq 4000 lub NovaSeq6000 lub wyżej) z zestawem odczynników umożliwiającym odczyt w trybie sparowanych końców o długości 2x150 nukleotydów. Spodziewana średnia liczba par odczytów na próbkę powinna wynosić 60M i w wyniku otrzymać około 9Gbp danych. Przynajmniej 85% powinno mieć odczyt Qscore>30. • Podstawowa analiza bioinformatyczna w ramach której uzyskane wyniki NGS zostaną: przefiltrowane, rozdzielone na poszczególne próby, usunięte zostaną sekwencje o niskiej jakości, złożony transkryptom referencyjny de novo, wykonane adnotacje do następujących baz: Blastp Blastx Eggnog Kegg Ncbi protein, Pfam Rfam GO (roślinnych), określona ekspresja transkryptów w poszczególnych bibliotekach oraz dostarczone zostaną wyniki liczbowe i graficzne o jakości nadającej się do publikacji naukowych.
  • II.1.4. Wspólny Słownik Zamówień (CPV): 73111000-3
  • II.1.5. Czy dopuszcza się złożenie oferty częściowej: nie

Sekcja III - Informacje o charakterze prawnym, ekonomicznym, finansowym i technicznym

  • III.2. Warunki udziału
  • Opis warunków udziału w postępowaniu oraz opis sposobu dokonywania oceny spełniania tych warunków: Zamawiający odstępuje od postawienia warunku w tym zakresie. Warunek zostanie spełniony poprzez złożenie oświadczenia o spełnieniu warunków udziału w postępowaniu.
  • Informacja o oświadczeniach i dokumentach, jakie mają dostarczyć wykonawcy w celu potwierdzenia spełniania warunków udziału w postępowaniu: Zamawiający przed udzieleniem zamówienia, wezwie Wykonawcę, którego oferta została najwyżej oceniona, do złożenia w wyznaczonym, nie krótszym niż 5 dni terminie, aktualnych na dzień złożenia oświadczeń i dokumentów: Wykaz usług sekwencjonowania DNA wykonanych w okresie ostatnich pięciu lat przed upływem terminu składania ofert, a jeżeli okres prowadzenia działalności jest krótszy - w tym okresie, wraz z podaniem ich rodzaju, wartości, daty i podmiotów, na rzecz których usługi te zostały wykonane, oraz kserokopię posiadanego certyfikatu jakości, z załączeniem dowodów określających czy usługi zostały wykonane należycie, przy czym dowodami, o których mowa, są referencje bądź inne dokumenty wystawione przez podmiot, na rzecz którego usługi były wykonywane, a jeżeli z uzasadnionej przyczyny o obiektywnym charakterze Wykonawca nie jest w stanie uzyskać tych dokumentów – inne dokumenty. Wzór wykazu stanowi załącznik nr 3 do niniejszej SIWZ. Odpis z właściwego rejestru lub z centralnej ewidencji i informacji o działalności gospodarczej, jeżeli odrębne przepisy wymagają wpisu do rejestru lub ewidencji, w celu potwierdzenia braku podstaw do wykluczenia w oparciu o art. 24 ust. 5 pkt. 1 Ustawy Pzp.

Sekcja IV - Procedura przetargowa

  • IV.1. Tryb udzielenia zamówienia
  • IV.1.1. Tryb udzielenia zamówienia: przetarg nieograniczony
  • IV.2. Kryteria oceny ofert
  • IV.2.2. Wykorzystana będzie aukcja elektroniczna: nie
  • IV.3. Informacje administracyjne
  • IV.3.5. Termin związania ofertą:

Zobacz następny przetargZobacz poprzedni przetargPobierz ofertę w pliku pdfPowrót na stronę główną

Podobne ogłoszenia o przetargach