Przetargi.pl
ZP/8/2012 Usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu

Gdański Uniwersytet Medyczny ogłasza przetarg

  • Adres: 80-210 Gdańsk, ul. M. Skłodowskiej-Curie 3a
  • Województwo: pomorskie
  • Telefon/fax: tel. (058) 349 12 23 , fax. (058) 349 12 24
  • Data zamieszczenia: 2012-02-03
  • Zamieszczanie ogłoszenia: obowiązkowe

Sekcja I - Zamawiający

  • I.1. Nazwa i adres: Gdański Uniwersytet Medyczny
    ul. M. Skłodowskiej-Curie 3a 3a
    80-210 Gdańsk, woj. pomorskie
    tel. (058) 349 12 23, fax. (058) 349 12 24
    REGON: 00028862700000
  • Adres strony internetowej zamawiającego: www.gumed.edu.pl
  • I.2. Rodzaj zamawiającego: Uczelnia publiczna

Sekcja II - Przedmiot zamówienia, przetargu

  • II.1. Określenie przedmiotu zamówienia
  • II.1.1. Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
    ZP/8/2012 Usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu
  • II.1.2. Rodzaj zamówienia: usługi
  • II.1.3. Określenie przedmiotu oraz wielkości lub zakresu zamówienia:
    1. Przedmiotem zamówienia jest usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu w ramach realizowanego projektu: Opracowanie molekularnych testów wspomagających wykrywanie wczesnego raka płuca - MOLTEST 2013. Projekt współfinansowany z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka, 2007-2013; 2. Wykonawca zapewni: A) wykonanie usługi metodą głębokiego sekwencjonowania (ang. next generation sequencing) DNA dla egzomu - dostarczonego przez zamawiającego materiału: 144 próbek DNA wyizolowanych z ludzkich kożuszków leukocytarnych standardowym zestawem firmy Qiagen (QIAamp DNA Blood Mini kit, nr kat 51104), w tym: egzonów genów kodujących białka, regionów nie ulegających translacji (sekwencje 3 i 5 UTR), niekodujących krótkich RNA, (w tym sekwencji kodujących, wymienionych w załączniku nr 4 do SIWZ - lista mikroRNA. B) Wśród analizowanych próbek będą 2 powtórzone próbki (tj. po 2 próbki od 2 pacjentów). C) Wykonawca przekaże Zamawiającemu uzyskane surowe dane na nośniku elektronicznym bez analizy statystycznej uzyskanych wyników. D) Dopuszczalny odsetek próbek, dla których niemożliwy jest odczyt surowych danych z głębokiego sekwencjonowania wynosi 3%. E) Wykonawca zapewnia, że wymagana usługa zostanie wykonana przy użyciu urządzeń spełniających wymagania systemu zgodności (certyfikowanych) z odpowiednimi normami dyrektyw UE. 3. Szczegółowo usługa obejmuje: Kontrolę jakości. Przesłanie drogą elektroniczną raportu dotyczącego przeprowadzonej kontroli jakości przesłanego materiału. Przygotowanie biblioteki DNA (ang. DNA library). Wzbogacanie egzomu (ang. exome enrichment). Wytwarzanie klastrów (ang. cluster generation). 4. Wymagania szczególne dla platformy do głębokiego sekwencjonowania: średnia głębokość sekwencjonowania (ang. coverage) - minimum 50 x, przestrzeń tarczowa (ang. target space) minimum 60 Mb (Mb=megazasad), minimum 20.000 genów, minimum 200.000 egzonów, 5. Próbki zostaną przesłane przez Zamawiającego na adres Wykonawcy wskazany w formularzu oferty. 6. Próbki zostaną przesłane do Wykonawcy na koszt Zamawiającego przesyłką kurierską w coolerach (schłodzone + 4-8°C). 7. Reklamacje będą zgłaszane drogą elektroniczną przez Zamawiającego. Wykonawca potwierdza mailowo przyjęcie reklamacji. W przypadku błędów Wykonawcy, zlecenie zostanie bezpłatnie wykonane ponownie w jak najkrótszym czasie, nie dłuższym jednak niż 30 dni robocze.
  • II.1.4. Wspólny Słownik Zamówień (CPV): 733110006
  • II.1.5. Czy dopuszcza się złożenie oferty częściowej: nie
  • II.1.6. Czy dopuszcza się złożenie oferty wariantowej: nie
  • II.1.7. Czy przewiduje się udzielenie zamówień uzupełniających: tak
  • II.2. Czas trwania zamówienia lub termin wykonania: 60 dni

Sekcja IV - Procedura przetargowa

  • IV.1. Tryb udzielenia zamówienia
  • IV.1.1. Tryb udzielenia zamówienia: przetarg nieograniczony
  • IV.2. Kryteria oceny ofert
  • IV.2.2. Wykorzystana będzie aukcja elektroniczna: nie
  • IV.3. Informacje administracyjne
  • IV.3.1. Adres strony internetowej, na której dostępna jest specyfikacja istotnych warunków zamówienia: www.gumed.edu.pl
  • IV.3.5. Termin związania ofertą, okres w dniach: 30 (od ostatecznego terminu składania ofert)

Zobacz następny przetargZobacz poprzedni przetargPobierz ofertę w pliku pdfPowrót na stronę główną

Podobne ogłoszenia o przetargach