Instytut Ogrodnictwa ogłasza przetarg
- Adres: 96-100 Skierniewice, ul. Konstytucji 3 Maja 1/3
- Województwo: łódzkie
- Telefon/fax: tel. 46 833 20 21 , fax. 46 833 32 28
- Data zamieszczenia: 2014-05-22
- Zamieszczanie ogłoszenia: obowiązkowe
Sekcja I - Zamawiający
- I.1. Nazwa i adres: Instytut Ogrodnictwa
ul. Konstytucji 3 Maja 1/3 1/3
96-100 Skierniewice, woj. łódzkie
tel. 46 833 20 21, fax. 46 833 32 28
REGON: 10102334200000 - Adres strony internetowej zamawiającego: ww.inhort.pl
- I.2. Rodzaj zamawiającego: Inny: Instytut Badawczy
Sekcja II - Przedmiot zamówienia, przetargu
- II.1. Określenie przedmiotu zamówienia
- II.1.1. Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
Usługa sekwencjonowania genomowego do realizacji projektu pt. Polskie szczepy Trichoderma w ochronie roślin i zagospodarowaniu odpadów organicznych nr umowy UDA-POIG.01.03.01-00-129/09-07, z dnia 15.09.2009 r - II.1.2. Rodzaj zamówienia: usługi
- II.1.3. Określenie przedmiotu oraz wielkości lub zakresu zamówienia:
Przedmiotem zamówienia jest: wykonanie usługi reakcji sekwencjonowania genomowego NGS polegająca na sekwencjonowaniu z przygotowaniem 48 barkodowanych bibliotek amplifikowanych fragmentów DNA wraz z opracowaniem wyników. Usługa obejmuje przygotowanie barkodowanych (znakowanych za pomocą swoistych sekwencji adaptorowych) produktów PCR oraz ich sekwencjonowanie na sekwenatorze pracującym w technologii sparowanych końców MiSeq 2x300bp PE. Zamawiający dostarczy Wykonawcy niezmieszane fragmenty DNA (produkty PCR) zamplifikowane z użyciem dostarczonych przez Wykonawcę zestawów starterów PCR w ilości nie mniejszej niż 100 ng każdy. Sumaryczna ilość odczytanych zasad z jednego sekwencjonowania to maksymalnie 25 mln sparowanych odczytów. Średnia długość pojedynczego odczytu to 300 zasad. Opracowanie wyników sekwencjonowania NGS obejmuje klasyfikację sekwencji do poziomu gatunku w oparciu o bazę danych sekwencji referencyjnych 16S rRNA oraz ITS (97% i 99% podobieństwa), drzewa filogenetyczne, podstawowe statystyki znalezionych jednostek taksonomicznych, wykresy (słupkowy, kołowy i powierzchniowy) składu taksonomicznego oraz analizy alpha- i beta-diversity (m.in. Chao1, odległość filogenetyczna, wykresy PcoA, UPGMA). Uzyskane zbiory wynikowe w postaci wygenerowanych automatycznie plików reakcji sekwencji DNA oraz plików wynikowych zostaną przekazane Zamawiającemu w wersji elektronicznej w terminie do 30 dni od momentu dostarczenia przez Zamawiającego do Wykonawcy kompletu 48 prób DNA. Zamawiający dostarczy Wykonawcy komplet 96 amplikonów (48 amplikonów 16S rRNA oraz 48 amplikonów ITS) w terminie do 10 dni licząc od daty podpisania umowy Szczegółowy zakres praw i obowiązków związanych z realizacją zamówienia określa wzór umowy stanowiący załącznik do SIWZ - II.1.4. Wspólny Słownik Zamówień (CPV): 731110003
- II.1.5. Czy dopuszcza się złożenie oferty częściowej: nie
- II.1.6. Czy dopuszcza się złożenie oferty wariantowej: nie
- II.1.7. Czy przewiduje się udzielenie zamówień uzupełniających: nie
- II.2. Czas trwania zamówienia lub termin wykonania: 40 dni
Sekcja III - Informacje o charakterze prawnym, ekonomicznym, finansowym i technicznym
- III.1. Warunki dotyczące zamówienia
- Informacja na temat wadium: Zamawiający nie wymaga wniesienia wadium
Sekcja IV - Procedura przetargowa
- IV.1. Tryb udzielenia zamówienia
- IV.1.1. Tryb udzielenia zamówienia: przetarg nieograniczony
- IV.3. Informacje administracyjne
- IV.3.1. Adres strony internetowej, na której dostępna jest specyfikacja istotnych warunków zamówienia: http://www.inhort.pl/zamowienia-publiczne
- IV.3.5. Termin związania ofertą, okres w dniach: 30 (od ostatecznego terminu składania ofert)
Zobacz następny przetargZobacz poprzedni przetargPobierz ofertę w pliku pdfPowrót na stronę główną
Podobne ogłoszenia o przetargach
- Sukcesywne usługi syntezy i sekwencjonowania
Dodano: 2016-07-26 - Wykonywanie diagnostycznych badań laboratoryjnych
Dodano: 2016-03-15 - Sukcesywne usługi sekwencjonowania i syntezy oligonukleotydów
Dodano: 2015-10-01 - Sukcesywne usługi sekwencjonowania i syntezy oligonukleotydów
Dodano: 2015-08-19 - Sukcesywne usługi sekwencjonowania i syntezy oligonukleotydów
Dodano: 2014-04-07 - Sukcesywne usługi sekwencjonowania DNA i transkryptomów oraz syntezy oligonukleotydów
Dodano: 2013-05-20 - Pobieranie prób i wykonanie badań laboratoryjnych wraz z opracowaniem wyników w zakresie parametrów fizykochemicznych i bakteriologicznych wody uzdatnionej i surowej oraz badania wód popłucznych ze stacji uzdatniania wody należących do Gminy Kutno w 2013 r.
Dodano: 2013-01-07 - Wsparcie merytoryczne Wydziału Technologii Laboratorium Drogowego w zakresie badań laboratoryjnych (kontrolnych) na inwestycjach realizowanych przez GDDKiA Oddział w Łodzi: a) Budowa autostrady A1 Toruń-Stryków, odcinek Kowal-Stryków od km 215+850 do km 295+850 - finansowanej ze środków POIiŚ, b) Budowa drogi ekspresowej S8 na odcinku: węzeł Walichnowy- Łódź(A1) odcinek:3 od km 0+000 do km 6+022,88, odcinki: 5÷9 od km 140+552,05 do km 204+000, współfinansowanej ze środków POIiŚ, c) Budowa autostrady A2 Stryków-Konotopa, odcinki:A od km 365+261,42 do km 394+500,B od km 394+500 do km 411+465,80
Dodano: 2012-06-28 - Wsparcie merytoryczne Wydziału Technologii Laboratorium Drogowego w zakresie badań laboratoryjnych (kontrolnych) na inwestycjach realizowanych przez GDDKiA Oddział w Łodzi:a) Budowa autostrady A-1 Toruń-Stryków, odcinek Kowal-Stryków od km 215+850 do km 295+850-finansowanej ze środków POIiŚ,b) Budowa drogi ekspresowej S8 na odcinku: węzeł Walichnowy- Łódź(A 1) odcinek:3 od km 0+000 do km 6+022,88, odcinki: 5÷9 od km 140+552,05 do km 204+000, współfinansowanej ze środków POIiŚ c) Budowa autostrady A-2 Stryków-Konotopa, odcinki:A od km 365+261,42 do km 394+500, B od km 394+500 do km 411+465,80
Dodano: 2012-05-21 - Obsługa laboratoryjna w roku 2012 na obiektach drogowych i mostowych
Dodano: 2012-04-16