Przetargi.pl
Usługa sekwencjonowania genomowego do realizacji projektu pt. Polskie szczepy Trichoderma w ochronie roślin i zagospodarowaniu odpadów organicznych nr umowy UDA-POIG.01.03.01-00-129/09-07, z dnia 15.09.2009 r

Instytut Ogrodnictwa ogłasza przetarg

  • Adres: 96-100 Skierniewice, ul. Konstytucji 3 Maja 1/3
  • Województwo: łódzkie
  • Telefon/fax: tel. 46 833 20 21 , fax. 46 833 32 28
  • Data zamieszczenia: 2014-05-22
  • Zamieszczanie ogłoszenia: obowiązkowe

Sekcja I - Zamawiający

  • I.1. Nazwa i adres: Instytut Ogrodnictwa
    ul. Konstytucji 3 Maja 1/3 1/3
    96-100 Skierniewice, woj. łódzkie
    tel. 46 833 20 21, fax. 46 833 32 28
    REGON: 10102334200000
  • Adres strony internetowej zamawiającego: ww.inhort.pl
  • I.2. Rodzaj zamawiającego: Inny: Instytut Badawczy

Sekcja II - Przedmiot zamówienia, przetargu

  • II.1. Określenie przedmiotu zamówienia
  • II.1.1. Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
    Usługa sekwencjonowania genomowego do realizacji projektu pt. Polskie szczepy Trichoderma w ochronie roślin i zagospodarowaniu odpadów organicznych nr umowy UDA-POIG.01.03.01-00-129/09-07, z dnia 15.09.2009 r
  • II.1.2. Rodzaj zamówienia: usługi
  • II.1.3. Określenie przedmiotu oraz wielkości lub zakresu zamówienia:
    Przedmiotem zamówienia jest: wykonanie usługi reakcji sekwencjonowania genomowego NGS polegająca na sekwencjonowaniu z przygotowaniem 48 barkodowanych bibliotek amplifikowanych fragmentów DNA wraz z opracowaniem wyników. Usługa obejmuje przygotowanie barkodowanych (znakowanych za pomocą swoistych sekwencji adaptorowych) produktów PCR oraz ich sekwencjonowanie na sekwenatorze pracującym w technologii sparowanych końców MiSeq 2x300bp PE. Zamawiający dostarczy Wykonawcy niezmieszane fragmenty DNA (produkty PCR) zamplifikowane z użyciem dostarczonych przez Wykonawcę zestawów starterów PCR w ilości nie mniejszej niż 100 ng każdy. Sumaryczna ilość odczytanych zasad z jednego sekwencjonowania to maksymalnie 25 mln sparowanych odczytów. Średnia długość pojedynczego odczytu to 300 zasad. Opracowanie wyników sekwencjonowania NGS obejmuje klasyfikację sekwencji do poziomu gatunku w oparciu o bazę danych sekwencji referencyjnych 16S rRNA oraz ITS (97% i 99% podobieństwa), drzewa filogenetyczne, podstawowe statystyki znalezionych jednostek taksonomicznych, wykresy (słupkowy, kołowy i powierzchniowy) składu taksonomicznego oraz analizy alpha- i beta-diversity (m.in. Chao1, odległość filogenetyczna, wykresy PcoA, UPGMA). Uzyskane zbiory wynikowe w postaci wygenerowanych automatycznie plików reakcji sekwencji DNA oraz plików wynikowych zostaną przekazane Zamawiającemu w wersji elektronicznej w terminie do 30 dni od momentu dostarczenia przez Zamawiającego do Wykonawcy kompletu 48 prób DNA. Zamawiający dostarczy Wykonawcy komplet 96 amplikonów (48 amplikonów 16S rRNA oraz 48 amplikonów ITS) w terminie do 10 dni licząc od daty podpisania umowy Szczegółowy zakres praw i obowiązków związanych z realizacją zamówienia określa wzór umowy stanowiący załącznik do SIWZ
  • II.1.4. Wspólny Słownik Zamówień (CPV): 731110003
  • II.1.5. Czy dopuszcza się złożenie oferty częściowej: nie
  • II.1.6. Czy dopuszcza się złożenie oferty wariantowej: nie
  • II.1.7. Czy przewiduje się udzielenie zamówień uzupełniających: nie
  • II.2. Czas trwania zamówienia lub termin wykonania: 40 dni

Sekcja III - Informacje o charakterze prawnym, ekonomicznym, finansowym i technicznym

  • III.1. Warunki dotyczące zamówienia
  • Informacja na temat wadium: Zamawiający nie wymaga wniesienia wadium

Sekcja IV - Procedura przetargowa

  • IV.1. Tryb udzielenia zamówienia
  • IV.1.1. Tryb udzielenia zamówienia: przetarg nieograniczony
  • IV.3. Informacje administracyjne
  • IV.3.1. Adres strony internetowej, na której dostępna jest specyfikacja istotnych warunków zamówienia: http://www.inhort.pl/zamowienia-publiczne
  • IV.3.5. Termin związania ofertą, okres w dniach: 30 (od ostatecznego terminu składania ofert)

Zobacz następny przetargZobacz poprzedni przetargPobierz ofertę w pliku pdfPowrót na stronę główną

Podobne ogłoszenia o przetargach